Một trăm hai mươi bốn dòng vi khuẩn đông tụ được phân lập trong một trăm năm mươi mẫu nước thải trại chăn nuôi heo đã qua xử lý bằng biogas ở các tỉnh đồng bằng sông Cửu Long. Kết quả kiểm tra sinh hóa với dung môi p-xylen, tuyển chọn được ba mươi hai dòng vi khuẩn có hiệu suất đông tụ cao từ 50,1-81,8%, khi cho các dòng vi khuẩn kết cặp với nhau, chọn được bốn cặp dòng vi khuẩn có hiệu suất đông tụ đạt từ 71 - 88% (KG.05+VL.01; KG.05+VL.05; KG.05+ST.02; VL.01+VL.05). Bằng phương pháp sinh học phân tử xây dựng cây phát sinh loài mười tám dòng vi khuẩn phân lập dựa trên trình tự 16S rRNA, liên kết với các trình tự trong cơ sở dữ liệu của GenBank để định danh vi khuẩn. Kết quả cho thấy quần thể vi khuẩn đông tụ trong nước thải trại chăn nuôi heo sau biogas có sự đa dạng về loài, phần lớn thuộc lớp Bacilli (94,4%) gồm các loài Bacillus subtilis (5,6%), Bacillus thuringiensis (5,6%), Bacillus aryabhattai (11,1%), Bacillus cereus (11,1%), Bacillus sp. (22,2%), Bacillus megaterium (38,8%) và  một lớp Gamma-proteobacteria  thuộc dòng Enterobacter sp. (5,6%). Loài vi khuẩn chiếm ưu thế trong quần thể vi khuẩn phân lập thuộc dòng Bacillus megaterium. Trong đó, cặp dòng Bacillus cereus_KG.05 với dòng Bacillus megaterium_VL.01 có hiệu suất đông tụ cao nhất (88%). Các loài vi khuẩn đông tụ được phân bố rộng khắp ở 13 tỉnh đồng bằng sông Cửu Long.